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illumina二代測序儀

更(geng)新時間:2022-06-12

簡要描述:

illumina二代(dai)測(ce)序(xu)儀MiSeq系(xi)統可(ke)通過(guo)各種測(ce)序(xu)應用為您的(de)研究提供便利。它能(neng)夠(gou)自動生成雙(shuang)端read,每(mei)次運行的(de)產出高達15 Gb,每(mei)條read可(ke)提供600多個堿基的(de)測(ce)序(xu)數據。它使(shi)用的(de)文庫制備試劑盒已針對多種應用進行了優(you)化,包(bao)括靶向基因(yin)測(ce)序(xu)、小型基因(yin)組測(ce)序(xu)、擴(kuo)增子測(ce)序(xu)、16S宏基因(yin)組學等。

Illumina公司推出MiSeq是一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數據分析的新款測序儀,每次運行能產生超過1Gb的數據,且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq的流程和準確性,讓它成為快速且經濟的遺傳分析的理想平臺,適合廣泛的應用。同時Illumina已被FDA大量采購并即將通過FDA認證,12年10月,MiSeq系統的測序通量已升級至8G左右。升級通過兩個方面完成,一個是cluster密度的增大,升級后cluster密度增加至15-17million,而pair-end讀取的reads數目將會增加至30-34million;另一方面是通過測序讀長而提升通量,測序讀長達到2*300bp,同時測序速度也有所提升。目前,Broad研究院已經利用現有試劑實現了單端測序300bp讀長,Illumina目前內部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些,都是保證在高質量數據結果的前提下完成的。


MiSeq性能參數


Illumina MiSeq測序時間(jian)和數(shu)據量


讀(du)長(bp)時(shi)間總數據量Q30
1×36~4 hrs540-610 Mb﹥90%
2×25~5.5 hrs750-850 Mb﹥90%
2×100~16.5 hrs3.0-3.4 Gb﹥85%
2×150~24 hrs4.5-5.1 Gb﹥80%
2×250~39 hrs7.5-8.5 Gb﹥70%



Illumina MiSeq讀取(qu)量比對


運行類型通過過濾的讀取(百萬(wan))
升級前升級后
單端(duan)讀取(qu)5-7 M15-17 M
末端配對讀取10-14 M30-34 M


工(gong)作流程


illumina二代測序儀 MiSeq四大(da)特性

1、較短(duan)的(de)實驗周(zhou)期:從樣(yang)品制備開始需要8小時即可得到超過100M的(de)高質量測(ce)序結果。

2、便捷的樣品制備(bei)流程:需50ngDNA模板,2小(xiao)時(shi)的自動化操作(zuo)就可以完成全部(bu)樣品制備(bei)工作(zuo)。

3、測序(xu)原理(li):MiSeq繼續GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序(xu)的化學原理(li)。

4、完(wan)整的整合功(gong)能:MiSeq可以獨(du)立完(wan)成(cheng)簇生成(cheng),雙向測序及(ji)數據分析工作,讓經費(fei)和實(shi)驗室空間不再(zai)成(cheng)為NGS研究(jiu)的障礙。


illumina二代測序儀 MiSeq應用范圍

1、轉錄組測序(xu)

派森諾MiSeq測(ce)(ce)序(xu)平臺是基因組已測(ce)(ce)序(xu)物種的(de)轉(zhuan)錄組分析平臺。公司(si)技術(shu)團隊(dui)目前已完成了包(bao)括斑馬(ma)魚在(zai)內的(de)多種植物、動物的(de)轉(zhuan)錄組測(ce)(ce)序(xu)及分析。


2、宏(hong)基因組16S rDNA單V區測序

對(dui)(dui)16s rDNA的單(dan)V區(qu)(qu)(V3\V4)進(jin)行高(gao)通(tong)量測序,鑒(jian)定細(xi)(xi)菌群和古生菌群。派森諾的技術團隊使用(yong)Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區(qu)(qu)并結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區(qu)(qu)成功(gong)的對(dui)(dui)雞的腸道環境(jing)細(xi)(xi)菌進(jin)行了鑒(jian)定。


3、Small RNA測序(xu)

1*35bp的(de)讀長配合了小(xiao)(xiao)(xiao)RNA的(de)測序長度,速度快,靈敏(min)度高。派(pai)森諾的(de)技(ji)術團隊目(mu)前(qian)已完成了鵝的(de)小(xiao)(xiao)(xiao)RNA測序和多種中草藥的(de)小(xiao)(xiao)(xiao)RNA測序。


4、重(zhong)測(ce)(ce)序(xu):包括(kuo)全基因組重(zhong)測(ce)(ce)序(xu)、簡化基因組測(ce)(ce)序(xu)、外顯子(zi)測(ce)(ce)序(xu)。

Illumina MiSeq非常(chang)適用于對(dui)微生(sheng)物(wu)基因(yin)組(zu)的(de)重測序,每次運行(xing)即可完(wan)(wan)成一個(ge)微生(sheng)物(wu)基因(yin)組(zu)測序。2011年12月(yue)27日,派森(sen)諾的(de)技術團(tuan)隊利用MiSeq一次運行(xing)同(tong)時(shi)完(wan)(wan)成了(le)(le)乳(ru)酸(suan)菌(Lactobacillus casei Zhang和(he)(he)Lactobacillus casei P8)的(de)重測序,基因(yin)組(zu)覆蓋深(shen)度為分(fen)別為404倍(bei)和(he)(he)213倍(bei),比對(dui)至參考(kao)序列,基因(yin)組(zu)實現全(quan)覆蓋,同(tong)時(shi)檢(jian)測到了(le)(le)多種結構變異,包括插入、缺失(shi)和(he)(he)SNP位(wei)點,并且檢(jian)測到了(le)(le)全(quan)部質粒。


數據展示

* 以(yi)上(shang)產(chan)品(pin)介紹(shao)及數(shu)據來源于Illumina,僅供參考,以(yi)Illumina為準。



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